Buenas, en mi caso sólo tuve este problema con el emulador ZSnes y el juego OutRun 2006, en ambos se solucionaba saliendo al escritorio, 'bajando' el juego a la barra de tareas, para acto seguido regresarlo al primer plano, no pude averiguar el motivo pero extrañamente servia para que las ralentizaciones se corrigieran.
Un amigo tuvo una incidencia aún más compleja en Alice Madness Returns, tenia que tocar varios apartados en el sistema operativo para corregir el rendimiento.. cada vez que quería jugar.
En estos casos y desde la ignorancia, sugiero hacer lo siguiente,
- Revisar y monitorizar la temperatura del procesador desde el S.O con alguna aplicación (HWmonitor por ejemplo)
- Optimizar el equipo con el programa Tune-Up o una aplicación similar.
- Desfragmentar el disco duro con
Defraggler- Analizar posible malware acumulado en el equipo con Hijackthis o Malwarebytes, porque en ocasiones afectan más a unas aplicaciones que a otras.
https://es.malwarebytes.com