Si, la diferencia entre juegos de poco tamaño entre aes y cd que no usen pistas de audio cda es muy pequeña: dos punteros en la rom de programa y la manera de almacenar los datos de audio y rom de programa, inteleaved y el bitswap. Aunque no hubieras compilado el juego para rom aes hubiera sido bastante fácil el parchearla usando winhex por ejemplo.
Hace mucho tiempo me encargué de realizar bastantes conversiones de ngcd a rom y viceversa, aunque ya tengo el tema bastante abandonado.
Un saludo!