Desaparecieron iconos en la bandeja del sistema

Tengo Ubuntu y con programas como Amarok o Amsn se quedaba el icono minimizado al lado de la hora, el caso es que no sé qué he tocado que ya no me aparecen y no hay manera d minimizarlos ahí, o sea que no los puedo cerrar del todo porque es como si estuvieran ahí pero no se ve el icono