Creo que ya se lo que has hecho.
Cuando has borrado el segundo disco, no solo lo has borrado, sino que además has borrado la partida. A ver, cuando vayas a borrar los juegos instalados, cuando te metes en el HD y encuentras el nombre del juego, puedes borrar directamente desde ahí, pero borraras TODO lo que atañe al juego (el propio juego, las partidas guardadas..). Si pulsas A sobre el nombre del juego, verás como en el interior encuentras las partidas y el disco instalado. Desde hay seleccionas el disco y lo borras, sin perder las partidas.
Es decir, es como una carpeta, si borras la carpeta, se borra todo lo que haya en el interior.
Te lo digo por propia experiencia, que borre toda mi partida del Rock Band.
No sé si ha quedado claro del todo..