Buenas,
lo primero paciencia y tranquilidad.
Me paso un caso igual, investigue y es complicado.
Yo lo resolví, de la siguiente manera:
Si es un Windows 7 y tiene activado las versiones anteriores o restaurar sistema, hay un programa que no me acuerdo pero que se encuentra googleando y recupera estas versiones anteriores o restauración del sistema por lo tanto puedes recuperar archivos, que es lo que yo hice.
Si no tienes Windows 7 y lo de las versiones anteriores pues te tocara investigar.
Esto no es una solución muy valida pero posiblemente por lo menos puedas recuperar datos, que de otra manera no tendrías.
Un saludo y suerte.
PD: ahora que me acuerdo, lo hice desde otro pc y el hd que estaba infectado lo puse en un adaptador usb, desde el pc instale ese programa y luego restaure los ficheros que había en las versiones anteriores o restauración en otro lugar y así recupere información. Si luego me acuerdo del programa lo digo.
PD2: Lo dicho, el programa es el shadow explorer. Haber si tienes suerte y puedes recuperar la información y luego, pues una reinstalación como dios manda y ponle Ubuntu
jejejeje pon el sistema que quieras.
Un saludo.