Supones mal, el winhiip no desfragmenta nada, lo unico que hace es que toma el espacio fragmentado y lo usa como primera opcion cuando se instala un juego nuevo, logrando asi una reduccion en el uso de espacio libre no usado con aterioridad, esto para mantener lo mas ordenado posible el disco duro.
Y la opcion scan/repair como su nombre lo dice, escanea y repara, no desfragmenta.
No hay programas propiamente para desfragmentar el hd de ps2 y la verdad no hace falta en si, solo que estes como loco instalado y desinstalando juegos.