Lo que necesitas para la extracción es una herramienta que se incluye con devkitpro, se llama ndstool y puedes buscarla por separado o lo más sencillo, que si ya tienes devkitpro descargado e instalado, busques la herramienta en sus directorios. Si no me equivoco debería estar en devkitpro\devkitarm\bin\
Saludos.