Hombre... no se que te molestara esa versión pudiendo jugar a juegos originales, pero si quieres quitarla actualiza vía Nintendo y ya esta, el problema esta en usar Updaters como el de Waninkoko que pueden instalar algún Ios stub con el riesgo que conlleva.
La 4.2 te quitara el homebrew instalado(excepto el HBC que tendrás que usar el Hackmii instaler para quitarlo) pero si la vas a usar tu yo lo veo una tontería quitarlo, igual algun dia quieres probar una cosa.Tu mismo.