Buenas, puedo escribir por mi experiencia propia. Tengo la switch con Xecuter. Yo he descargado actualizaciones desde la eshop, actualizaciones como paquetes de idiomas (skyrim) y actualizaciones de versiones, desde la CFW, con una diferencia de 2 semanas. Eso fue al mes des salir en CFW. Nunca he jugado online.
Por suerte no me banearon en su momento, pero desde agosto no me he conectado, asi que no se como esta mi asunto con Nintendo, si estoy baneado o no de sus servidores.
Desde entonces, creo, que Nintendo es cada vez mas estricta, y ahora por cualquier cosa puede banear.
Si quieres mi opinion, da igual si no conectas o no, desde que lo modificastes, sabes que tarde o temprano te van a banear. Por ende, no vas a poder actualizar desde la eshop. Ademas, si no entras mas a la eshop por tu cuenta, te has bloqueado tu mismo, intentando no entrar nunca a la eshop, actualizando por .nsp. ESTAS EN LA MISMA.