Las tres diferencias más importantes son que la versión de Wii está invertida (aunque mucha de la prensa "especializada" diga que la versión invertida es la de GC), soporte para 480p y formato de pantalla panorámica. Como mi TV ni es HD ni es panorámica me la sudan bastante estas diferencias, yo tan feliz jugando a mi versión de GC.
Salvo eso, los gráficos son los mismos. Personalmente me quedo con la versión de GC, por un control más ajustado (el soporte del wiimote en este juego está bastante pillado por los pelos, se nota que en un princpio solo estaba pensado para GC) y por poseer la perspectiva original.