Hay juegos que tienen cajas distintas segun el pais donde se lanzaron o quien los lanzó, por ejemplo de Star Wars también hay caratula de color lila.
En el caso de Star Wars, si no es de otro país, es muy posible que una de las caratulas sea del lanzamiento original y la otra de cuando Nintendo relanzó el juego en la época de 32 bits (años 96-97, si no recuerdo mal).
Edito: Si te refieres al cartucho, puede deberse a exactamente lo mismo.
