El hardware es exactamente el mismo en ambos flash. El por qué tienen diferentes marcas pueden ser dos cosas:
1.-El flash es un producto OEM y cada compañía lo vende con su propia marca, el fabricante con el nombre de R4 DS y M3 con el nombre de M3 Simply.
2.-Es una táctica empresarial para evitar en todo lo posible compartir mercado debido a la fuerte competencia de flash card que hay actualmente en el sector. Es decir, la compañia M3 desarrolla el flash y lo vende con 2 marcas distintas, uno un poco más caro pero con el respaldo de la marca M3, y otro más asequible con una marca nueva, en este caso R4. De esta manera abarcan ambos mercados, el de los usuarios que buscan un flash con el respaldo del M3 Team y el de los que buscan el producto "similar" un poco más barato.
La versión "oficial" es la primera, pero yo me inclino más por la segunda teoría, viendo las similitudes del software de ambos flash.