No te entiendo muy bien.
Puede referirse a que tienes un disco duro en NTFS (WinXP) y otro en FAT32 o EXT3(linux) por ejemplo y al abrir el explorador ver el contenido, el cual esta en formato de otro SO. Bueno, no se si tiene mucho que ver con lo que me dices ,jeje.
Otra opcion es que dentro de un SO tengas una , máquina virtual con otro SO. Por ejemplo tienes Linux y con el programa Virtual Box creas una máquina virtual para que corra WinXP.