He estado mirando, y lo he solucionado así:
Con respecto al antimalware, se soluciona, desactivando de inicio el windows defender, lo tengo activo, pero no de inicio.
Lo de instalar updates, era por eso, me estaban saltando 4 o 5 updates, y hasta que las busca, instala y las deja bien, se come todos los recursos. Una vez queda instalado, todo vuelve a la normalidad, disco al 0%, memoria al 25% tengo 8GB ddr4 (he quitado la paginación) y el cpu oscila entre 5-10%.
ahora todo vuelve la normalidad y la velocidad es la esperada y la que tenía el primer día.
Si que me he dado cuenta, independientemente de esto, que el Update Anniversary, hace que el PC tarde más en iniciar.
Es nuevo mi máquina, no tengo nada apenas, solo office, chrome y programas de simulación electrica (cadesimu, schempalic, festo Fluidsim) y una utilidad para programación de autómatas OMROM.