Wenas!!!
Yo no te diria 100% que se jodiera la PS2 por el calor de los hdd (algunos mas que otro, dependiendo de la velocidad de cada uno), pero para prevenir intenta mantener la PS2 bastante ventilada mientras usas el hdd.
Yo le pongo un ventilador de casa frente por frente a la rejilla, y se nota como evacua aire caliente.
Salu2