¡Hola topete_!
Aquí, en el foro, pude encontrar una tema respeto al asunto:http://www.elotrolado.net/hilo_como-reconocer-pendrive-ntfs_1074292 a ver si te parecerá interesante.
En la mayoría de los casos, los discos duros externos se recomienda que sean formateados en el formato de FAT32 para poder utilizarlos en la consola de juegos de PS3. Te sugiero que hagas una copia de seguridad de los que tienes guardado en el disco duro externo en otro lugar, ya que si cambias el formateo, vas a perder los datos.
Saludos.