Buenos Días,
A ver... yo tengo también un disco duro de 1TB que uso para la PS3 y la Wii conjuntamente.
Si particionas el disco duro y quieres que esa partición la lea la PS3 debe de ser : FAT 32
Si no quieres que lea la otra partición por que es para tu uso común pues puedes ponerla en: NTFS
Yo en la Wii la otra partición por ejemplo es en: WBFS.
Espero que te sirva de ayuda.
Gracias Y un Saludo