La posición de los ventiladores depende en parte del resto de ventiladores de la caja.
Para empezar, si le pones dos ventiladores, dado que es una torre y las láminas son horizontales, lo que siempre debes hacer es poner los dos ventiladores en el mismo sentido, es decir, que el aire entre por un ventilador y lo saque por el otro, nunca los pongas los dos metiendo o los dos sacando por que entonces el aire no tendrá por donde fluir y eso no refrigerará nada.
Luego ya está el tema de cómo poner los ventiladores. La manera más lógica (suponiendo que miras como si mirases a una caja) es así:
<-|||<-
Siendo ||| el disipador y <- los ventiladores echando aire en ese sentido. ¿Por qué es mejor así? por que es de suponer que tienes un ventilador trasero en la caja que se encarga de sacar el aire.
Otra opción (como por ejemplo lo tengo yo) es ponerlo así:
Es lo mismo que el caso anterior, pero aprovecho que la caja tiene ventilador arriba y que el aire caliente tiende a subir para generar un mejor flujo de aire.
Realmente te da lo mismo que el aire vaya hacia atrás o hacia arriba, la diferencia de temperatura es casi despreciable, de la misma manera, no es necesario poner dos ventiladores en serie en el disipador (es decir, así <- <-) ya que la diferencia anda entre los 2ºC y los 4ºC.
Sobre el resto de la caja, lo ideal es que entre aire por el frontal de la caja y salga por detrás, así el resto de componentes se "ventilan" ellos solitos con el aire fresco que viene de delante (por lo general con temperatura más baja). Es decir, algo de este palo:
Si necesitas más ayuda de cómo orientar tus ventiladores o de dónde ponerlos pon más datos del equipo que tienes: gráfica, caja, etc., alguna fotillo tampoco estaría de más. De todas formas, siempre puedes inspirarte en los equipos del resto de eolianos que verás
en un hilo de por aquí cerca.