Hay cosas como SuperOS que si lo habeis mirado es una Ubuntu (con sus repos) con paquetes preinstalados, pero usan ademas un repositorio de terceros extra propio, que no son mas que unos repositorios de terceros extras (dropbox, peazip, teamviewer, de google, etc).
En ese caso es beneficioso, pues por ejemplo a mi me permite tener actualizado paquetes que de otra forma tendria que monitorizarlos aparte o añadir otros repositorios menos confiables ^^.