No es culpa de la distro, es del flash. Hagas lo que hagas, el flash irá de culo...
Solución? reproducir los vídeos con reproductores normales. Normalmente, cuando cargas una web con flash, dichos archivos aparecen en temporales. Si vas a la carpeta de los temporales y buscas el fichero flash, podrás reproducirlo con VLC, Mplayer o alguno de estos, de manera mucho más fluida. Además, si no recuerdo mal, evitas el problema de los 72 minutos.
EDITO: NaNdO, maldito, te has adelantado.