Depende del contenedor de video que estes usando, por ejemplo los contenedores AVI, MKV y MP4 admiten hasta 8 pistas de audio y otras 8 de subtitulos.
Como sea, la pista de audio extra que vas a introducir la exportas como audio desde el editor de video que uses, asi si tu video qeu has hecho usa como formato del stream de audio el formato MP3, el audio que exportes sera tambien en MP3, si usas formato AAC en tu video igual exportaras la pista de audio extra en formato AAC.
Para agregar esa pista de audio extra:
Para contenedor AVI, usamos el antiquisimo VirtualDUBMOD, abrimos el archivo AVI en VirtualDUBMOD, vamos al menu STREAM>Stream_List, en la nueva ventana usamos el boton ADD y buscamos el archivo MP3 o AAC o AC3 que vamos a agregar. Nos deben aparecer ya dos pistas de audio, pulsamos aceptar. En el menu VIDEO usamos VIDEO>Direct_Stream_Copy, con esto no recodificaremos el video dejando intacta su calidad, y por ultimo vamos al menu FILE>Save_As y le damos un nombre al arcchivo nuevo AVI... Listo, ya tendremos un archivo contenedor AVI con 2 streams de audio.
Para contenedor MP4, usamos el multiplexor MP4Box y el GUI YAMB, abrimos YAMB, del panel izquierdo CREACION>Click_para_crear_un_archivo_MP4. A la ventana de YAMB arrastramos el archivo de video al que deseamos agregar el audio y despues arrastramos el otro archivo de audio que vamos a agregar [AC3 o DTS o AAC], en el campo para nombre del archivo, elegimos como salida MP4 y le damos un nuevo nombre y pulsamos el boton siguiente. Listo, ya tendras un archivo MP4 con dos streams de audio.
Para contenedor MKV, usamos el multiplexor MKVMERGE_GUI que viene en el paquete MKVToolNix, en la ventana de MKVMERGE_GUI arrastramos el archivo de video al que deseamos agregar audio, despues arrastramos el archivo de audio que vamos a agregar [AC3, MP3, AAC, DTS, Ogg], damos un nombre de archivo en el campo para nombre y pulsamos el boton START MUXING... en pocos segundos tendremos un archivo contenedor de video MKV con dos streams de audio.
Un multiplexor no es un codificador, el multiplexor solo crea el archivo contenedor de salida y mete en el una copia de los streams de audio y video que hemos elegido, con lo que no altera la calidad del audio y el video y hace el proceso en segundos.
Los multiplexores MKVMERGE y MP4Box aceptan varios contenedores de video como entrada [avi, mkv, mov, mp4, m4v.] pero solo dan salida a MKV en MKVMERGE y solo en MP4 para el MP4Box.
