En Windows Vista tienes que guardar la carpeta profiles, que está aquí:
C:\Usuarios\TU USUARIO\AppData\Local\VirtualStore\Program Files\Activision\Call of Duty 4 - Modern Warfare\players\profiles
(esto en teoría, aunque yo lo tengo instalado en un disco duro distinto del de Windows y esa carpeta la tengo dentro del directorio del juego. Pero vamos, sabiendo que lo que necesitas es la carpeta profiles no es difícil encontrarla aunque no hayas hecho una instalación por defecto).
En Windows XP, está en esta ruta:
C:\Archivos de Programa\Activision\Call of Duty 4 - Modern Warfare\players\profiles
Copias la carpeta profiles y la guardas en un USB, una tarjeta SD, un disco duro externo, una partición o donde quieras. Después del formateo y de reinstalar el juego, sustituyes la carpeta profiles por ésta que habías guardado y listo. OJO, tienes que usar la misma cd-key para que tu perfil se haya guardado. Si has hecho la copia de una carpeta profiles de un COD4 que instalaste con un cd-key y más adelante vuelven a instalar el COD4 con otro serial distinto, ese perfil que guardaste no te servirá.