Da perrera responder a estas cosas tan elementales cuando se pueden buscar con el boton de busqueda.
Un dol es un ejecutable de gamecube, lo pongas donde lo pongas.
Respecto a las roms. Graba todo, en sus directorios correspondientes, en un dvd o minidvd tal cual, lo q uses, y despues con la bios que tengas le das a explorar el dvd (iso 9660, etc).
En el caso de snes, ejecuta el juego.dol directamente.
en el caso de nes, ejecuta el zelda.dol y desde las opciones del emulador puedes cargar cualquier otro juego en .nes
au