1) Puerto mas cercano a la CPU: 1xPCI Express x16 a x16 (PCIEX16)
AQUÍ DEBES PONER LA TARJETA GRAFICA
2) Segundo puerto PCI-E 1xPCI Express x16, a velocidad x8 (PCIEX8) cuando el primer PCI-E esta ocupado
* El segundo PCI-E comparte las lineas PCI-E con el primer puerto (donde pusiste la grafica) al estar ese puerto ocupado este segundo PCI-E reduce sus lineas a la mitad convirtiéndose en x8 (PCIEX8)
3) Tercer puerto (y ultimo puerto) 1xPCI Express x16, a x4 (PCIEX4) (aunque tiene la forma de un x16 en realidad es un x4)
Justo encima de este puerto encontraras una ranura M.2 blanca (mira imagen) hay es donde es mas recomendable en mi opinión poner el SSD ¿porque no en los otros te preguntaras? pues porque en el primer puerto M.2 deshabitara lo puertos 4 y 5 (que por otra parte si no los usas no hay problema en que uses dicho puerto para el ssd) (por el tema de que compartes lineas) y en el caso del segundo puerto...este queda tapado totalmente por la gráfica cuando la tienes colocada por lo que no es muy bueno para la temperatura del SSD.
Aparte de esos puertos tú placa base también dispone de 3xPCI Express x1 (los puertos pequeñitos de color negro) estos puertos sirven para pequeños componentes tales como por ejemplo tarjetas wifi, receptores de TV y de mas cosas "simples" que consumen poco.
* El tercer slot PCIEX1 comparte ancho de banda con el conector SATA1. El conector SATA1 queda deshabilitado cuando se usa ese puerto PCIE.
IMAGEN ILUSTRATIVA
En la imagen se puede apreciar que hay un SSD conectado al primer puerto M.2 (este recuerda que nunca debes usarlo porque tú gráfica perderá ancho de banda)
) ya he editado mi primer post perdón por el error 
