Al disco duro no se como iria ni donde se pondria, eso mejor que lo diga alguno de estos mostros que saben mucho mas que yo de esto.
Respecto a colocarlos en chips, como pueda ser la GPU o la CPU, se colocan encima, las sondas (o al menos las que he visto) son unas laminitas muy muy finas metalicas que se colocona directamente sobre el chip... Con eso te da la temperatura "real" del dispositivo....
Respecto a modificar la velocidad de los fans... Es muy facil, mas voltaje mas potencia, mas potencia mas velocidad de giro... Menos voltaje menos potencia, menos potencia menos velocidad... Hay dispositivos que sirven para regular el voltajes de los ventiladores y asi regular tambien su velocidad de giro.