Gracias por la respuesta!
He conseguido hacer funcionar de nuevo el HyperSync, tenía unos errores en la configuración que he corregido editando el fichero .ini a mano (si no recuerdo mal, está en %appdata%roaming\Hypersync.
Con ésto, ya sincroniza y descarga bien, pero bueno, si existe algo más allá, mucho mejor, porque veo que me faltan aún muchas wheels y videos y me da la impresión de que en la web de hypersync y emumovies no están subiendo todo, y hay varios temas (por ejemplo, akai katana) que hay que descargar a mano (parece que no están donde quiera que deban estar para que el hypersync los descargue bien)