Los puedes poner donde quieras y que quepan, ya que en el XBMC puedes navegar por todo el HD. Bueno, ahora que me fijo, estás hablando del XBMP, ese no recuerdo, pero creo que también podías navegar por las carpetas con él.
Eso sí, yo te recomiendo el XBMC en vez del XBMP, está más actualizado y completo.
Saludos.