Prueba, en la BIOS, a asignarle la IRQ en la que esté configurada la tarjeta ISA (5.7, 10, etc,,) a "ISA" en vez de a "PCI" y pon en "SO PnP" "NO" en vez de "YES". Con esto yo he conseguido que tarjetas ISA tanto PnP como no (de scanner y SCSI, aunque no de sonido), se encuentren y/o se configuren correctamente en el Win98.