Esas instrucciones de instalación no se de donde la habrás sacado, pero son erróneas, las reales o actualizadas son estas:
Installation
Run this program from the same directory as the game executable. XInput library files exist with several different names and some games require a change in its name. Known names:
• xinput1_4.dll
• xinput1_3.dll
• xinput1_2.dll
• xinput1_1.dll
• xinput9_1_0.dll
Tienes que extraer el x360ce en la carpeta raiz del juego y ya ahí ejecutar la aplicación, la aplicación te dirá de crear los dlls necesarios, te los crea, cierras la aplicación y ejecutas el juego normalmente desde steam y al iniciar el juego, si te detecta bien el x360ce oirás un sonido, como una campana.
Te aconsejo que lo bajes de aqui
http://www.x360ce.com/ ya que al ser la página oficial el programa esta más actualizado y te explica lo que te he dicho, tienes que ejecutar el programa en la carpeta donde esta el ejecutable del juego, además tienes las dos versiones, de 32 bits y de 64 bits. La mayoria de veces solo funciona en los juegos el de 32 bits, aunque hay algunos que necesitan el de 64 bits, como es el GTA V.