Pero aquí se están mezclando cosas.
SI metes un programa q en las USE (no en las dependencias) pone q necesita kde, no es q necesite el kde, sino q lo q se instala es el "soporte" para ciertos añadidos q solo kde tiene. Por poner un ejemplo:
Yo me instalé el gestor de correo Sylpheed y en las use me decia q necesitaba el USE xface. Pues no activé esta use y al abrir un correo con una foto no se veia la foto en pequeñito en los adjuntos, sino q me mostraba solo el nombre del fichero. Activé esta use y ahora si q se ve la foto.
Con el tema q expones pasa lo mismo. Si la aplicación necesita la USE kde y no la pones puede q los iconos salgan diferentes, o no tengas los themes mas chulos o vete a saber, pero de funcionar funciona (siempre y cuando cumplas dependencias).
En el caso del k3b, si no le activas la USE dvd no tendrás soporte para dvd, pero el programa funciona igualmente, y con todas las aplicaciones lo mismo.
