Que quieres hacer? coger una ROM de 16bits y meterla en 2 EPROMs de 8 bits? es eso?
Para hacer eso tiene que hacer un split de la ROM separando el byte mas significativo del byte menos significativo. O sea Hi-ROM y LO-ROM. No se si Ucom64 hace eso o simplemente corta el binario por offset o posicion de memoria... no es lo mismo partir una ROM para meterla en memorias de 16 bits que partirla para meterla en memorias de 8 bits.
Por eso si partes una ROM de 16bits y 1Mb en 2 ROMs de 8bits te quedan 2 ROMs de 1Mb pero 8bits
Habia una utilidad para separar los bytes de las ROM de megadrive en 2 binarios, se llamaba bin2hilo.exe
Aunque deberias aclarar que buscas hacer? como las conectas a los buses de datos-direcciones? porque quitar el 74LS139?