posiblemente usaste algun autointalador o directamente volcaste unas carpetas a la psp sobrescribiendo.
El caso es que con toda seguridad machacaste el fichero vsh.txt de la carpeta ms0:/seplugins que es donde se indica que plugins se activan al entrar en el xmb.
El irShell tiene un plugin que al activarlo, hace que al encender laconsola entre en el irShell automaticamente. Al machacar la configuración de los plugins, ahora lo que entra directamente es el remotejoy.
Solucion (supongo que los programas están en los lugares por defecto):
Conecta la psp por usb al ordenador
edita el fichero
ms0:/seplugins/vsh.txt
añade la linea:
ms0:/seplugins/irsautoboot.prx
DEsconecta el usb
Apaga del todo la consola
enciende con R pulsado
Activa el plugin
irsautoboot.prx
Sal del recovery
Esto debería no solo solucionar el problema, si no además darte una explicación de que ha pasado
XD