La Playstation 3 soporta 3D en juegos a partir del firmware 3.30, y películas Blu-ray 3D a partir del 3.50. Eso es lo principal que debes tener en cuenta, da igual si usas tus discos originales o copias de seguridad para cargarlos. La necesidad de un firmware superior depende de cada juego, tenga 3D o no.
Seguro que por el foro encuentras temas sobre cómo cargar copias de seguridad usando eboots modificados y que funcionen en 3.41, para así no tener que actualizar el firmware en el que funciona tu pskey. Si lo que te interesa principalmente es películas bd3d tendrás que optar por un custom firmware 3.55.
Saludos.