Si se nota la velocidad de acceso, copiado y borrado. Aunque las cajas Firewire están un poco caras a mi ver, con USB2.0 tampoco es que vaya lento, a mi 400mb me los mueve en 7sg, es preferible dar el salto al FireWire 800.
Con Time Machine hace una copia de seguridad en ese disco duro de 2GB, te olvidas de crear particiones en el disco duro, poder, se puede, pero OS X no es que se te vaya a estropear si no eres muy manazas (usar cuenta administrador para navegar, instalar a mansalva sin saber que es, tocar cosas que no sabes, etc...). Y como la copia es compatible con todos los OS X, pues siempre lo tendrás a salvo tus documentos.
Yo te recomiendo usar el disco duro en su totalidad para Snow Leopard.