Bueno, no es quitarlos sino cortocircuitarlos, porque si los quitas entonces no llegará señal al conector porque se queda en alta impedancia.
Yo modifiqué un cable RGB de cube oficial cortocircuitando dichos condensadores y lo podía usar sin problemas tanto con SNES como con GC. Eso sí, dependiendo de la televisión, podría salirte la imagen de GC demasiado brillante. Pero hasta que no se prueba no se sabe.
Lo que la N64 no emite RGB. Hay que mirar si lleva un ramdac en concreto y añadir un amplificadorcito de video para después llevar la señal RGB al conector. Un follón, vamos.