Es que algunos saves están 'protegidos' e impide copiarlos a la sd, como la del smash. Creo que tienes dos formas, ambas con el HBC. La primera es usar el savegame extractor para pasarlo a la sd, pero luego necesitarias el savegame installer para poder instalarlo en tu wii (o en otra).
La otra forma creo que es (que me corrijan si me equivoco) con el BL, le das a la opcion de cargar desde el canal disco (asi se parcheara) y podras copiar tus partidas. Con esta forma no necesitas el savegame para poder volverla a copiar a otra wii.
En cuanto para convertir de .bin a .dat? Si son las .bin de fotos (por ejemplo del smash) si que hay un programa para convertirlos, si no, nose xD