Si 'algo debe pasar' sino ¿para que hacerlo?, otra cosa que digas 'algo malo pueda pasar' y ahi la respuesta es no.
Como sea, tu subwoofer activo en realidad es un amplificador 2.1, por algo tiene las entradas del audio estereo [canal izquierdo y canal derecho] e igual las salidas estereo para unas bocinas pasivas. Asi que el conectar la salida amplificada del subwoofer; que es monoaural; la puedes realizar de ambas maneras, y ya podras ahcer las pruebas de cual te convence mas, aunque en teoria debe ser lo mismo en cuanto al audio recibido.
Ahora, lo que tambien haria es ir al AVR HT y bajar el NIVEL del canal de salida del LFE [subwoofer], en algunos viene numerado el nivel del 1-10, otros del 1-8, como sea, yo lo pondria a la mitad o a un tercio, esto para no 'saturar' al amplificador de salida de tu amplificador 2.1, no le pasara nada si se satura con la señal, pero lo que si es que se distorcionara el audio que te de el amplificador 2.1.
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