Yo siempre he leido que lo mejor antes de cargarla es agotarla para evitar el efecto memoria. Creo que las baterías modernas ya no tienen este problema, pero siendo Sony como es yo no esperaría que la batería de Vita fuese para tirar cohetes, yo por si acaso la gasto primero antes de cargarla a tope.
También decían que si vas a tirarte mucho tiempo sin usar la consola, lo ideal es que la guardes con la batería con poca carga.
Por lo demás creo que da igual, no se me ocurre ninguna pega para no cargarla mientras juegas, eso si, la consola se calienta cuando lo haces pero mientras no te resulte molesto no creo que pase nada.