los empresarios normalmente "los descuentan", es decir, que como no lo trabajas no lo cobras.
lo puedes llevar a un abogado laboral o graduado social y plantear una reclamacion de cantidades.
la mayoria de trabajadores, si efectivamente no lo trabajan, no suelen reclamar no cobrar esas horas.
otra opcion es "recuperar" las horas (es decir, trabajar esas horas "que debes" en otro horario), y asi cobrarlas. cosa que no aconsejo porque es hacerle el caldo gordo al empresario.
en teoria se deberian pagar igual que "se les pagan" (no se les descuentan) a los que trabajan jornada completa, pero por algun motivo los empresarios suelen interpretar que las medias jornadas son siempre a medida y los trabajadores, como ya digo, no suelen "tocar los que no suenan" con estas cuestiones.
mi consejo si te da igual que no vas a estar mucho tiempo alli es reclamarlo, pero reclamandolo por via judicial, nada de en plan colegas con el empresario. siempre puedes sentarte con el empresario o supervisor, claro, pero al final este hara lo que le de la gana o lo que le ordenen desde arriba que para eso tienen el mando.