La Supercard puede cargar los juegos de GBA desde el modo NDS, tras la carga se reinicia automáticamente la consola en modo gba y el juego empieza.
Sin embargo hay algunso backups que deben estar corruptos (o se corrompen al pasarlos por el parcheador de SuperCard), puesto que al cargarlos desde el modo NDS, cuando la consola pasa a modo GBA, en la animación que sale, el logotipo de NIntendo aparece con basura, y tras la animación la consola se queda bloqueada. Estos backups la única forma de ejecutarlos es arrancando la consola en modo GBA.