Lo que te dijeron es completamente FALSO. Con las flashcarts de 3DS como Gateway, 3DSLink o MT Card (que para usarlas tu consola debe tener un firmware entre 4.1 y 4.5 OBLIGATORIAMENTE) puedes jugar en 3D como si de un juego original se tratase. Ahora, no confundas las flashcarts que te mencioné anteriormente con cualquier R4 de esas que funcionan en NDS y DSi, esas solo pueden ejecutar backups de NDS, nunca de 3DS.
Saludos