Duda de Pokemon (Diamond)

1) Puedes atrapar a, absolutamente todos los pokemon entre las dos versiones (Diamond y Pearl)?

¿A qué te refieres con absolutamente todo?
Necesitarás las ediciones antiguas para terminar la colección.
Por ejemplo, una vez tengas el Pokétore, podrás atrapar Pokémon de las ediciones antiguas en las zonas de hierba alta, pero solo algunos.
También tendrás que esperar las famosas manadas que se anunciaban en la tele en Zafiro/Rubí/Esmeralda, cuando te avisaban que habían muchos Surskit en la Ruta 117, pues aquí ocurre algo parecido. A lo mejor te avisan de una manada de Zigzagoon en la ruta tal.
Para poder a empezar a atrapar Pokémon que no sean de la Pokédex de Shinou, primero tienes que conseguir la Pokédex Nacional.
Los que verdaderamente no podrás atrapar, y tendrás que transferirlos mediante Pal Park (método de transferencia de Pokémon de Ediciones GBA, puedes transferir 6 de tus antiguos Pokémon al día) serán los iniciales (Bulbasaur, Cyndaquil, Mudkip...), los legendarios (Articuno, Entei, Registeel, Mewtwo...) y los secretos (Mew, Celebi, Jirachi y Deoxys).

2) Habéis probado la compatibilidad con los backups de Rojo Fuego, Verde Hoja y Esmeralda? se pueden intercambiar pokemons?

A ver... Todos sabemos que muchos Flashcarts necesitan un menú para cargar los backups, por lo tanto, si estás jugando a Pokémon D/P, no podrás seleccionar el Backup de Z/R/E/VH/RF.
Eso sí, existen Flashcarts (como EFA Linker) cuyo Software te permiten grabar una sola rom sin menú, y ésta arranca automáticamente al encender. Vamos, como si fuera una copia exacta de un cartucho original, hablando físicamente.

3) En caso de que no se puedan atrapar a todos los pokemon en Diamond/Pearl, que versiones del juego necesito para tenerlos todos? Rojo Fuego, Verde Hoja y Esmeralda?

Pues... Seguramente tendrás que pedirle algunos a otras personas, porque creo que no tendrás todas las ediciones de GBA (a lo mejor me equivoco xD).
Verás, cuando estás jugando a D/P, y tienes por ejemplo el Pokémon Zafiro insertado en la ranura de GBA, en algunas zonas aparecerán salvajes Lotad, Lombre, Sableye, Lunatone y Seviper, aquellos que eran exclusivos en Zafiro.
En caso de tener la Rubí, pues Seedot, Nuzleaf, Mawile, Solrock y Zangoose.
Con las ediciones de Verde Hoja, Rojo Fuego y Esmeralda ocurre lo mismo, pero ahora no recuerdo cuales eran.
Eso sí, independientemente de la edición del juego de GBA insertado, aparecerán también Gastly y Haunter salvajes.

Espero haber podido responder a tus preguntas y aclarar tus dudas .

Un saludo!

Absolutamente todo, me refiero a poder atrapar desde los pokemons del primer juego (rojo/azul) hasta el último (esmeralda?).

Osea que básicamente tenemos que tener todo en los cartuchos originales o no podremos atraparlos todos...
Mi hermano tiene algunos, pero no todos... vaya, yo que quería aprovechar esta versión nueva de pokemon y atraparlos todos