Si si, es que uno de los tipos de ordenación es en carpetas y hay otro en los que los juegos salen uno debajo de otros...
Otra cosa es que se haya borrado la informacion de cada archivo y por eso no te los meta en carpetas, ponte sobre un icono de un juego y dale al triangulo y a información o algo asi, te sale lo que ocupa el archivo, etc, etc...una de las cosas era el nombre de la carpeta donde se meterá el juego, por defecto creo que iba a "Desconocido", manualmente puedes cambiar la carpeta, revisalo a ver si están vacios.
Pero que es raro que si cambias la ordenación no se te ordene en carpetas aunque sea que te los meta a todos en la misma