Cuando ejecuta juegos de NGC, Wii se convierte automáticamente en una NGC, por lo que no funciona ninguna de las características de Wii (Wiimote, memoria interna, SD, etc.) por lo que necesitas un mando de NGC y una Memory Card de NGC. Esto también responde a tu pregunta del volver al menú de Wii.
Esto se hizo así para que no hubiera problemas de compatibilidad, como los hay en otras consolas.