Eso me ha pasado alguna que otra vez, aunque no recuerdo si en el mismo sistema y emulador que dices.
Lo que te recomiendo es que para este tipo de sistemas uses el emulador específico y no multiemuladores y similares. Sobre todo porque son sistemas más complejos y jodidos a la hora de ser emulados. Sé que no es tan, tan cómodo así pero consigues evitar ese tipo de problemas y optimizar bien la emulación.
Saludos.