El reloj de los juegos de Pokemon lo unico que hace es que en determinados momentos ocurran cosas asociadas a fenomenos horarios. Por ejemplo que hayan ciertos pokemon que solo aparezcan por la noche (no se si es el caso)
Normalmente si juegas sin reloj lo unico que te pasara es que esos fenomenos no se produzcan (en realidad no creo que sean mas de 2-3 por juego) pero el juego puedes jugarlo sin problemas.
Por otro lado si eres pokemaniaco tal vez quieras "catch them all" y entonces mejor te compras el flash con reloj interno.
Como ya he dicho, creo que EFA y EZ lo mejor.