Lee un poco en el foro, esta mas que explicado. pero te hago un resumen.
Cuando hagas una copia de un blueray de un juego el solito te creara la carpeta donde tienes que poner siempre tus juegos.
Cada programa que crea las copias de los juegos lo hace en una ruta diferente, unas lo hacen en el GAME y otros en el GAMEZ (siempre en mayusculas) Segun el que vas a usar tienes que ponerlo en uno o en otro.
Lo mejor es hacer tu mismo un backup de un disco y luego mirar donde te lo ha grabado. El multiman ahora mismo no me acuerdo donde lo guardaba, creo que era en la carpeta GAME.
Puedes tener todo lo que quieras en el disco duro externo, independientemente de si la ps3 lo reconozca o no.
Y acuerdate que para que lo reconozca tiene que estar en formato FAT32, si esta en NTSC no lo reconocera la ps3.
Saludos y lee un poco, todo esto esta mas que explicado.