Que yo sepa no, entre otras cosas porque los juegos de GameCube con mapear los botones ya está. En Wii se usa el control de movimiento en casi todos aunque sólo sea para algo nimio por lo que no basta con configurar un mapeo de botones universal, habría que modificar y adaptar juego a juego.
Para que lo entiendas de otra forma, podrías jugar con un mando de PS3 en Nintendont al Donkey Konga o al Odama? Pues es lo mismo, como mucho podrían adaptar otros mandos para sustituir al de GameCube en aquellos juegos que lo acepten. Y creo que algunos juegos que apenas usan el sensor de movimiento tienen algún mod para jugarse con el mando clásico de Wii (New Super Mario Bros y DKCR creo).
Saludos.