Como han comentado, eso depende de la Región y Hz de la MD, que ha de estar modificada, para que una vez cargas la BIOS del Mega-CD desde el EverDrive pueda reconocerte el juego japonés aunque tu Mega-CD sea PAL, y ejecutarlo a 60Hz.
...PERO...
Existen incompatibilidades: Juegos que por este sistema se bloquean si están en un Mega-CD que no es de su región y no funcionan a través de la carga de BIOS desde EverDrive, porque necesitan "comprobar continuamente que el hardware es de su región". Uno de éstos, creo recordar, era precisamente el Silpheed americano. Esto se soluciona usando back-ups con la región de la ISO cambiada a la del Mega-CD mediante parcheo, para iniciarla en dicha región y luego cambiar los Hz desde la MD mod.
Curiosamente, en algunos casos, generalmente ISOs japonesas, no funcionan con el cambio a región PAL mediante parcheo, por lo que hay que jugarlas directamente en su región.
En cualquier caso, teniendo una MD con mod Hz+Región, un Mega-CD aunque sea PAL, y un EverDrive desde el que cargar las diferentes BIOS de Mega-CD, siempre hay algún modo de poder jugar a cualquier juego de cualquier región a su velocidad adecuada.