Yo usaba megamanager, pero acabé harto, cuando queria me desconectaba mi cuenta y tenia que estar todo el rato metiendo de nuevo el usuario y clave, etc....
Para hacer lo que dices, hay un boton que era como un + para meter un solo enlace y otro que era una hoja de papel para meter varios.
Pero te recomiendo jdowloader, seleccionas lo que quieres, das a copiar, y automaticamente te lo pone y te dice si están online o no, y encima una vez descargado algo comprimido en partes, el programa solito te lo comprime, que eso es un gustazo, jeje
A mi megamanager me iba de pena, me lo puse porque pensaba que al ser de ellos, era el mejor, pero para nada es asi